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Zentralinstitut für Ernährungs- und Lebensmittelforschung (ZIEL)

Abteilung Mikrobiologie
Technische Universität München
Weihenstephaner Berg 3
D-85350 Freising


Evolutionsbiologie

Prof. Dr. Siegfried Scherer
und Mitarbeiter

Durch zahlreiche mikrobiologische und molekularbiologische Methoden bearbeiten wird das Vorkommen, den Ursprung und die Funktion von überlappenden Genen in Bakterien (vgl die Arbeitsgruppen Funktionale Charakterisierung und Evolution überlappender Gene)






Zum Zweiten bin ich an der theoretischen Analyse evolutionärer Prozesse interessiert. Welche mikroevolutiven Prozesse werden beobachtet? Wie weitreichend sind diese? Wie schnell können sie ablaufen? Auf welche Weise wird biologische Information durch Mikroevolution verändert? Wurden mikroevolutive Prozesse beobachtet, welche im Lauf der Zeit zu makroevolutiven Transitionen führen können oder umfasst ein makroevolutiver Wandel zusätzliche Faktoren?

Schließlich finde ich es nützlich und wichtig, die epistemiologischen Hintergründe von empirischen Theorien zur Mikroevolution und von historisch-empirischen makroevolutiven Theorien zu analysieren. 




Ausgewählte Publikationen

Hücker SM, Vanderhaegen S, Abellan-Schneyder I, Wecko R, Simon S, Scherer S , Neuhaus K (2018) A novel short L-arginine responsive protein-coding gene (laoB) antiparallel overlapping to a CadC-like transcriptional regulator in Escherichia coli O157:H7 Sakai originated by overprinting. BMC Evolutionary Biology, BMC Evolutionary Biology 18:21. doi: 10.1186/s12862-018-1134-0

Scherer S (2017) Denkvoraussetzungen und weltanschauliche Überzeugungen in der Biologie. In: Lüke U, Souvignier G (Hrsg) Wie objektiv ist Wissenschaft? WBG Darmstadt, S. 45-80.

Böhm M-E, Huptas C, Krey V, Scherer S (2015) Massive horizontal gene transfer, strictly vertical inheritance and ancient duplications differentially shape the evolution of Bacillus cereus enterotoxin operons hbl, cytK and nhe. BMC Evolutionary Biology 15:246   

Fellner L, Simon S, Scherling C, Witting M, Schober S, Polte C, Schmitt-Kopplin P, Keim DA, Scherer S, Neuhaus K (2015) Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting. BMC Evolutionary Biology 15:283.

Scherer S (2010) Hat die Biologie das Leben erklärt? In: Thim-Mabrey C, Brack-Bernsen L, Täuber D (Hrsg.) Naturwissenschaftliche Aussagen und sozial verantwortbare Entscheidungen. Noderstedt 2010. Seite 133-183
 
Scherer S (2009) Makroevolution molekularer Maschinen: Konsequenzen aus den Wissenslücken evolutionsbiologischer Naturforschung. In: Hahn HJ, McClary R, Thim-Mabrey C (Hrsg.) Atheistischer und jüdisch-christlicher Glaube: Wie wird Naturwissenschaft geprägt? Forschungssymposium vom 02.-04.04.2008 an der Universität Regensburg, Noderstedt, Seite 95-149

Fuchs TM, Bresolin G, Marcinowski L, Schachtner J, Scherer S (2008) Insecticidal genes of Yersinia spp.: taxonomical distribution, contribution to toxicity towards Manduca sexta and Galleria mellonella, and evolution. BMC Microbiology 8:214.
 
Ehling-Schulz M, Svensson B, Guinebretiere MH, Lindback T, Andersson M, Schulz A, Fricker M, Christiansson A, Granum PE, Martlbauer E Nyguyen-The C, Salkinoja-Salonen M and S. Scherer S (2005) Emetic toxin formation of Bacillus cereus is restricted to a single evolutionary lineage of closely related strains. Microbiology 151:183-197 

Loewe L, Textor V, Scherer S (2003) High deleterious genomic mutation rate in stationary phase of Escherichia coli. Science 302, 1558-1560.

Scherer S, Lechner S, Böger P (1993) psbD sequences of Bumilleriopsis filiformis (Heterokontophyta, Xanthophyceae) and Porphyridium purpureum (Rhodophyta, Bangiophycidae): evidence for polyphyletic origin of plastids. Current Genetics 24: 437-442.


Scherer S, Herrmann G, Hirschberg J, Böger P (1991) Evidence for multiple xenogenous origins of plastids: Comparison of psbA genes with a xanthophyte sequence. Current Genetics 19: 503-507.

Scherer S (1990) The protein molecular clock: Time for a re-evaluation. Evolutionary Biology 24, 83-106.

Scherer S (1989) The relative rate test of molecular evolution: A note of caution. Molecular Biology and Evolution 6, 436-441.

Scherer S (1983) Basic functional states in the evolution of cyclic photosynthetic electron transport. Journal of Theoretical Biology 104, 289-299.

 




Aktuelles

Paper
Dynamic Proteome Alteration and Functional Modulation of Human Saliva Induced by Dietary Chemosensory Stimuli (2018)

Paper
Genome sequence of the novel virulent bacteriophage PMBT14 with lytic avtivity against Pseudomonas fluorescens DSM 50090 (2018)

Paper
The Novel Anaerobiosis-Responsive Overlapping Antisense to the Annotated Gene ECs2385 of Escherichia coli O157:H7 Sakai (Mai 2018)

Paper
Thermal treatment of skim milk concentrates in a novel shear-heating device: Reduction of thermophilic spores and physical properties (Febr. 2018)

Paper
A novel short L-arginine responsive protein-coding gene (laoB) antiparallel overlapping to a CadC-like transcriptional regulator in Escherichia coli O157:H7 Sakai originated by overprinting (2018)

Paper
Comparison between Listeria sensu stricto and Listeria sensu lato strains identifies novel determinants involved in infection (2017)

Paper
Denkvoraussetzungen und weltanschauliche Überzeugungen in der Biologie (2017)

Paper
Differentiation of ncRNAs from small mRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) by combined RNAseq and RIBOseq-ryhB encodes the regulatory RNA Ryhb and a Peptide, RyhP. (2017)

Paper
Complete circular genome sequence and temperature independent adaptation to Anaerobiosis of Listeria weihenstephanensis DSM 24698 (2017)

Paper
Discovery of numerous novel small genes in the intergenic regions of the Escherichia coli O157:H7 Sakai Genome (2017)

Paper
Spoilage of Microfiltered and Pasteurized Extended Shelf Life Milk Is Mainly Induced by Psychrotolerant Spore-Forming Bacteria that often Originate from Recontamination (2017)

Paper
Transcriptional and translational regulation by RNA thermometers, riboswitches and the sRNA DsrA in Escherichia coli O157:H7 Sakai under combined cold and osmotic stress adaptation. (2016)

Paper
Comparative Bioinformatics and Experimental Analysis of the Intergenic Regulatory Regions of Bacillus cereus hbl and nhe Enterotoxin Operons and the Impact of CodY on Virulence Heterogeneity (Mai 2016)

Paper
Acidified nitrite inhibits proliferation of Listeria monocytogenes - Transcriptional analysis of a preservation method (März 2016)

Paper
Translatomics combined with transcriptomics and proteomics reveals novel functional, recently evolved orphan genes in Escherichia coli O157:H7 (EHEC)

Paper
Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting (Dez. 2015).

Paper
Massive horizontal gene transfer, strictly vertical inheritance and ancient duplications differentially shape the evolution of Bacillus cereus enterotoxin operons hbl, cytK and nhe (Nov. 2015)