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ZIEL Institute for Food and Health

               
                  
 
Vereinigung für allgemeine und angewandte Mikrobiologie

 





Der Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie steht unter der Leitung von Siegfried Scherer. (Department of Molecular Life Sciences, TUM School of Life Sciences). Der Lehrstuhl ist mit dem ZIEL -  Institute for Food & Health assoziiert.

Im Mittelpunkt der Grundlagenforschung stehen hauptsächlich funktionale Genomik und Evolution 
neuer überlappender Gene der Krankheitserreger E.coli  EHEC und Pseudomonas aeruginosa. 
Daneben werden die Themengebiete Taxonomie und Biodiversität sowie Evolutionsbiologie bearbeitet. 
 
Anwendungsorientierte Forschungsvorhaben in Kooperation mit der Industrie konzentrieren sich auf die mikrobielle Ökologie von Lebensmitteln, insbesondere auf die Analyse der Mikrobiota und Hygiene sowie die Sekretion und Funktion von proteolytischen Enzymen aus kältetoleranten Pseudomonaden.

Die FTIR basierte Hochdurchsatzidentifizierung von Mikroorganismen führte zur Entdeckung und formalen Beschreibung zahlreicher neuer Spezies und Gattungen. Im Rahmen dieser Arbeiten wurde eine etwa 13.000 Isolate umfassende Stammsammlung lebensmittelrelevanter Bakterien und Hefen aufgebaut. 

Ein dritter Aufgabenbereich des Lehrstuhls umfasst die mikrobielle Diagnostik durch FTIR-Spektroskopie und molekulare Methoden sowie die Beratung für die Lebensmittelindustrie zur Prävention und Aufklärung von mikrobiologisch verursachten Schadensfällen. 







     

abgeschlossene Promotionen  







  

 

 

Aktuelles

Paper
High Counts of thermophilic spore Formers in dairy powders originate from persisting strains in processing lines (2020)

Paper
Dynamically evolving novel overlapping gene as a factor in the SARS-CoV-2 pandemic (Okt. 2020)

Paper
Are antisense proteins in prokaryotes functional (2020)

Paper
Complementary use of cultivation and high-throughput amplicon sequencing reveals high biodiversity within raw milk microbiota (2020)

Paper
Recommendations for bacterial ribosome profiling experiments based on bioinformatics evaluation of published data (2020)

Paper
OLGenie: Estimating natural selection to predict functional overlapping genes (2020)

Paper
Genetic Organization of the aprX-lipA2 Operon Affects the Proteolytic Potential of Pseudomonas Species in Milk (2020)

Paper
Brevilactibacter flavus gen.nov., sp. nov., a novel bacterium of the family Propionibactericeae isolated form raw milk and dairy products and reclassification of Probioniciclava sinopodophylli as Brevilactibacter sinopodophylli comb. nov. (2020)

Paper
A novel pH-regulated, unusual 603 bp overlapping protein coding gene pop is encoded antisense to ompA in Escherichia coli O157:H7 (EHEC). (2020)

Paper
Pseudomonas haemolytica sp. nov., isolated from raw milk and skimmed milk concentrate (2020)

Paper
Pseudomonas saxonica sp.nov. isolated from raw milk and skimmed milk concentrate. (2020)

Paper
Thermally induced milk fouling: Survival of thermophilic spore Formers and potential of contamination (Dez 2019)

Paper
Optimality in the standard gentic code is robust with respect to comparison code sets (2019)

Paper
Accurate quantification of thermophilic spores in dairy powders (2019)

Paper
Pseudomonas lactis sp. nov. and Pseudomonas paralactis sp. nov., isolated from bovine raw milk (2017)

Paper
Resistance of thermophilic spore formers isolated from milk and whey products towards cleaning-in-place conditions: Influence of pH, temperature and milk residues (2019)

Paper
Proposal of Lysobacter pythonis sp. nov. isolated from royal pythons (Python regius) (2019)

Paper
The novel EHEC gene asa overlaps the TEGT transporter gene in antisense and is regulated by NaCl and growth Phase (Dez 2018)

Paper
Reprogramming Human Siderocalin to Neutralize Petrobactin, the Essential Iron Scavenger of Anthrax Bacillus (2018)

Paper
Dysfunction, Disease, and the Limits of Selection (2018)

Paper
The Novel Anaerobiosis-Responsive Overlapping Antisense to the Annotated Gene ECs2385 of Escherichia coli O157:H7 Sakai (Mai 2018)

Paper
A novel short L-arginine responsive protein-coding gene (laoB) antiparallel overlapping to a CadC-like transcriptional regulator in Escherichia coli O157:H7 Sakai originated by overprinting (2018)